MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 chromosome

Total Repeats: 91092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010498	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170684018
2	NC_010498	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	170684018
3	NC_010498	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	170684018
4	NC_010498	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	170684018
5	NC_010498	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170684018
6	NC_010498	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
7	NC_010498	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	170684018
8	NC_010498	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170684018
9	NC_010498	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
10	NC_010498	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170684018
11	NC_010498	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	170684018
12	NC_010498	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	170684018
13	NC_010498	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
14	NC_010498	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170684018
15	NC_010498	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170684018
16	NC_010498	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170684018
17	NC_010498	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170684018
18	NC_010498	CTG	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
19	NC_010498	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	170684018
20	NC_010498	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170684018
21	NC_010498	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	170684018
22	NC_010498	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170684018
23	NC_010498	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170684018
24	NC_010498	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
25	NC_010498	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170684018
26	NC_010498	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170684018
27	NC_010498	TCT	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170684018
28	NC_010498	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	170684018
29	NC_010498	GAAG	2	8	1481	1488	50 %	0 %	50 %	0 %	170684018
30	NC_010498	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170684018
31	NC_010498	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170684018
32	NC_010498	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
33	NC_010498	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170684018
34	NC_010498	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
35	NC_010498	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170684018
36	NC_010498	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170684018
37	NC_010498	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170684018
38	NC_010498	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170684018
39	NC_010498	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	170684018
40	NC_010498	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
41	NC_010498	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170684018
42	NC_010498	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170684018
43	NC_010498	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
44	NC_010498	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
45	NC_010498	TTCT	2	8	2239	2246	0 %	75 %	0 %	25 %	170684018
46	NC_010498	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
47	NC_010498	GAACTG	2	12	2412	2423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170684018
48	NC_010498	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170684018
49	NC_010498	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
50	NC_010498	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170684018
51	NC_010498	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
52	NC_010498	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684018
53	NC_010498	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170684018
54	NC_010498	GCT	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170684018
55	NC_010498	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170681884
56	NC_010498	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170681884
57	NC_010498	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170681884
58	NC_010498	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170681884
59	NC_010498	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	170681884
60	NC_010498	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170681884
61	NC_010498	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170681884
62	NC_010498	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681884
63	NC_010498	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170681884
64	NC_010498	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170681884
65	NC_010498	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681884
66	NC_010498	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170681884
67	NC_010498	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	170681884
68	NC_010498	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	170681884
69	NC_010498	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681884
70	NC_010498	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	170681884
71	NC_010498	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170681884
72	NC_010498	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	170681884
73	NC_010498	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170681884
74	NC_010498	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	170682268
75	NC_010498	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170682268
76	NC_010498	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170682268
77	NC_010498	CG	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	170682268
78	NC_010498	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170682268
79	NC_010498	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170682268
80	NC_010498	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170682268
81	NC_010498	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170682268
82	NC_010498	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	170682268
83	NC_010498	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170682268
84	NC_010498	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170682268
85	NC_010498	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170682268
86	NC_010498	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170682268
87	NC_010498	GATG	2	8	4632	4639	25 %	25 %	50 %	0 %	170682268
88	NC_010498	AGCC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	170682268
89	NC_010498	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170682268
90	NC_010498	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170682268
91	NC_010498	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170682268
92	NC_010498	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170682268
93	NC_010498	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	170682268
94	NC_010498	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170682268
95	NC_010498	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170682268
96	NC_010498	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170682268
97	NC_010498	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170682268
98	NC_010498	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170680562
99	NC_010498	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170680562
100	NC_010498	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170680562
101	NC_010498	CGC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170680562
102	NC_010498	ATC	2	6	5483	5488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170680562
103	NC_010498	ATC	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170680562
104	NC_010498	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170680562
105	NC_010498	GCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170682084
106	NC_010498	GGA	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170682084
107	NC_010498	TCA	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170682084
108	NC_010498	AAG	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170682084
109	NC_010498	CAGT	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	170682084
110	NC_010498	AAT	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170682084
111	NC_010498	TCA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170682084
112	NC_010498	TTC	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170682084
113	NC_010498	TTC	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170682084
114	NC_010498	CAC	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170682084
115	NC_010498	TGC	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170682084
116	NC_010498	TTG	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170682084
117	NC_010498	TGA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170682084
118	NC_010498	AAATCG	2	12	6038	6049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170682084
119	NC_010498	AGCG	2	8	6156	6163	25 %	0 %	50 %	25 %	170682084
120	NC_010498	GCT	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170682084
121	NC_010498	GTG	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170682084
122	NC_010498	GCC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170680075
123	NC_010498	GTT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170680075
124	NC_010498	AGA	2	6	6717	6722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170680075
125	NC_010498	ATC	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170680075
126	NC_010498	CGC	2	6	6988	6993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170680075
127	NC_010498	TGCCGC	2	12	6994	7005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170680075
128	NC_010498	CGC	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170680075
129	NC_010498	GCC	2	6	7096	7101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170680075
130	NC_010498	GCCA	2	8	7113	7120	25 %	0 %	25 %	50 %	170680075
131	NC_010498	CAG	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170680075
132	NC_010498	AAT	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170680075
133	NC_010498	GGA	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170680075
134	NC_010498	CG	3	6	7440	7445	0 %	0 %	50 %	50 %	170680075
135	NC_010498	AGA	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170680075
136	NC_010498	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170680075
137	NC_010498	GCCA	2	8	7609	7616	25 %	0 %	25 %	50 %	170680075
138	NC_010498	CG	3	6	7632	7637	0 %	0 %	50 %	50 %	170680075
139	NC_010498	CAA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170680075
140	NC_010498	TAA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170680075
141	NC_010498	A	6	6	7832	7837	100 %	0 %	0 %	0 %	170680075
142	NC_010498	GCAT	2	8	7842	7849	25 %	25 %	25 %	25 %	170680075
143	NC_010498	CGT	2	6	8057	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170681632
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146	NC_010498	CAAC	2	8	8221	8228	50 %	0 %	0 %	50 %	170681632
147	NC_010498	TC	3	6	8232	8237	0 %	50 %	0 %	50 %	170681632
148	NC_010498	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	170681632
149	NC_010498	TTGA	2	8	8274	8281	25 %	50 %	25 %	0 %	170681632
150	NC_010498	CAG	2	6	8304	8309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170681632
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152	NC_010498	CAG	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170681632
153	NC_010498	CGAC	2	8	8341	8348	25 %	0 %	25 %	50 %	170681632
154	NC_010498	TGC	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170681632
155	NC_010498	AAG	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170681632
156	NC_010498	CTG	2	6	8592	8597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170681632
157	NC_010498	TTG	2	6	8656	8661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170681632
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159	NC_010498	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170681632
160	NC_010498	TAC	2	6	8757	8762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170681632
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163	NC_010498	A	6	6	9052	9057	100 %	0 %	0 %	0 %	170681632
164	NC_010498	CTG	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170681632
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252	NC_010498	CAG	2	6	13853	13858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170682035
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257	NC_010498	A	6	6	13955	13960	100 %	0 %	0 %	0 %	170682035
258	NC_010498	ATT	2	6	14065	14070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170683873
259	NC_010498	ACC	2	6	14146	14151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170683873
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261	NC_010498	GGC	2	6	14280	14285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170683873
262	NC_010498	GCG	3	9	14290	14298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170683873
263	NC_010498	GGC	3	9	14304	14312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170683873
264	NC_010498	GGC	2	6	14358	14363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170683873
265	NC_010498	GTC	2	6	14371	14376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170683873
266	NC_010498	GCG	2	6	14382	14387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170683873
267	NC_010498	CG	3	6	14386	14391	0 %	0 %	50 %	50 %	170683873
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269	NC_010498	CTT	2	6	14576	14581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170683873
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273	NC_010498	GCA	2	6	14674	14679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170683873
274	NC_010498	GTTCAG	2	12	14787	14798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170683873
275	NC_010498	AAC	2	6	14832	14837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170683873
276	NC_010498	CGG	2	6	14993	14998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170683873
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278	NC_010498	GCT	2	6	15068	15073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170683873
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282	NC_010498	GAC	2	6	15165	15170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170683873
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288	NC_010498	T	6	6	16461	16466	0 %	100 %	0 %	0 %	170681886
289	NC_010498	AATC	2	8	16488	16495	50 %	25 %	0 %	25 %	170681886
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291	NC_010498	TGT	2	6	16547	16552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170681886
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295	NC_010498	ATA	2	6	16747	16752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170681886
296	NC_010498	GCC	2	6	16903	16908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170683329
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379	NC_010498	CGTT	2	8	21092	21099	0 %	50 %	25 %	25 %	170684120
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382	NC_010498	ATT	2	6	21328	21333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170681624
383	NC_010498	CGC	2	6	21520	21525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170681624
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385	NC_010498	CCAC	2	8	21567	21574	25 %	0 %	0 %	75 %	170681624
386	NC_010498	TGC	2	6	21579	21584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170681624
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388	NC_010498	CCA	2	6	21710	21715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170681624
389	NC_010498	GAA	2	6	21743	21748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170681624
390	NC_010498	CGG	2	6	21749	21754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170681624
391	NC_010498	TGA	2	6	21847	21852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681624
392	NC_010498	TGA	2	6	21861	21866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681624
393	NC_010498	GAT	2	6	22006	22011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681624
394	NC_010498	CGG	2	6	22020	22025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170681624
395	NC_010498	ATT	2	6	22047	22052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170681624
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418	NC_010498	GTA	2	6	22961	22966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170681287
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420	NC_010498	TAA	2	6	23043	23048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170681287
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422	NC_010498	AGCC	2	8	23163	23170	25 %	0 %	25 %	50 %	170681287
423	NC_010498	TTTC	2	8	23173	23180	0 %	75 %	0 %	25 %	170681287
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431	NC_010498	GCA	2	6	23896	23901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170681287
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454	NC_010498	TA	4	8	25009	25016	50 %	50 %	0 %	0 %	170680613
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497	NC_010498	T	6	6	27506	27511	0 %	100 %	0 %	0 %	170680169
498	NC_010498	TGA	2	6	27573	27578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684022
499	NC_010498	TGA	3	9	27673	27681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170684022
500	NC_010498	CAT	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170684022

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